Entries from 2019-03-01 to 1 month

PymolをインストールするならAnacondaがいいよ

この間のエントリーでMacへのPymolのインストールの仕方を少し書きました. Homebrewを使ってインストールする場合はPymolをコンパイルするのにXcodeという開発ツールが必要になりますが,これだけで数十GBの容量が必要になるので僕のMacBookAirにはまさに重…

Magic Me

水素原子をMe基で置換することにより,conformationの変化やDIを惹起して劇的な活性の向上が見られることがあります.このようなMe基はMagic Methyl (group)と呼ばれ,LEやLLEなどの重原子あたりのリガンド効率に大きく寄与します。 そんなMe基についてのリ…

Hydrogen bond

分子内水素結合に関する報告集です。 経口薬を目指すなら<3にはおさめたいかなと個人的には思います。 Theoretical hydrogen bonding parameters for drug design www.sciencedirect.com How hydrogen bonds impact P-glycoprotein transport and permeabili…

フッ素

フッ素についてのまとめです。 一旦リンクだけ貼っておきます。 The Many Roles for Fluorine in Medicinal Chemistry https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/jm800219f Fluorination Patterning: A Study of Structural Motifs That Impact Physicochemical…

アミンのまとめ

アミンに関する総説やメモです。 Predicting and Tuning Physicochemical Properties in Lead Optimization: Amine Basicities https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/cmdc.200700059 “Stretched” Analogues of Piperidine, Piperazine, and Mor…