OpenMM用の仮想環境を構築する - おじさんちのクソゲ

OpenMM、というかGROMACSで遊ぼうと思って作った仮想環境の備忘録です。

サンプルコードはこんな感じ。。

conda create -n openmm -c conda-forge python=3.10 openmm openmm-setup pymol-open-source

ちなみに下記のようにcudatoolkit を入れようとすると-c conda-forgeが使えないので、pymol-open-sourceを別に入れた方がいいのかもしれない。

conda create -n openmm -c conda-forge python=3.10 openmm openmm-setup pymol-open-source cudatoolkit=11.2

PyMOLは-c conda-forgeでopen source版をインストールできるので覚えておいて損はないと思います。