最初のFROM --platform=linux/amd64 ubuntu:latestに集約されますが、M1 MacでDockerfileを単にbuildしようとすると、minicondaのインストールでエラーが出ました。 というわけでとりま突貫のdockerfileです。 拡張子なしでcurrent directoryに保存して、下…

Dockerの全体像 https://penpen-dev.com/blog/docker-command/ 出力される結果は各自の環境で異なるので参考程度にしてください。 Contents 新しい環境を構築する Containerで作業する 環境を破棄する Dockerfile Reference 新しい環境を構築する docker hub…

前回までのこちらの記事でChEMBLからダウンロードしたデータを可視化できるように加工しました。 ChEMBLのデータを整える - おじさんちのクソゲ 既に構造や骨格の情報となるMol fileをSMILES stringsから生成してるので、今回は続きとして同じDataFrameを使…

前回紹介した方法はほぼほぼコピペでした。 .only() で取得する項目を限定していましたが、全データを取得しようとするとどうなるでしょう？ activities = new_client.activity.filter( target_chembl_id__in='CHEMBL3553', pchembl_value__gte=5, assay_typ…